現行勞保費率的結構為5.5%的普通事故保險費率和1%的就保費率，總計為6.5%，年金制開辦後，普通事故保險費率將從現行5.5%調高到6.5%。至於就保費率，則可望調降到0.5%，總計為7%。所以對勞雇雙方來說，年金制上路的前兩年保費負擔將從6.5%增加到7%。

保費負擔的比率則維持不變，雇主負擔七成、勞工兩成、政府一成。所以若以月投保薪資3萬元計算，雇主每月將多增加105元保費，一年下來將增加1,260元；勞工每月將多繳30元保費，一年將多繳360元。

由於年金制費率採固定階梯式調整，年金制開辦後前兩年雖然不調整，但第三年開始每兩年將調升0.5個百分點，所以一旦年金制開辦後，勞雇雙方的保費負擔將會逐漸增加。